- 一千二百九十五 科尔沁的臣服
- 一千二百九十六 光脚的不怕穿鞋的
- 一千二百九十七 大秦拒绝和西班牙人来往
- 一千二百九十八 卑微吧，仰望吧，跪下抱头唱征服吧！
- 一千二百九十九 隆武盛世
- 一千三百 爹爹，我怕
- 一千三百零一 秦军独步全球
- 一千三百零二 皇帝即国家
- 一千三百零三 阅兵式（上）
- 一千三百零四 阅兵式（下）
- 一千三百零五 与虎谋皮
- 一千三百零六 买卖来了
- 一千三百零七 希望之光
- 一千三百零八 赵士祯的担忧
- 一千三百零九 成功的政策
- 一千三百一十 赵士祯不想深究
- 一千三百一十一 他只是皇帝（上）
- 一千三百一十二 他只是皇帝（下）
- 一千三百一十三 真正的开国封赏
- 一千三百一十四 你还是乖乖蹲着吧！
- 一千三百一十五 郭家的一天（上）
- 一千三百一十六 郭家的一天（下）
- 一千三百一十七 徐光启下乡（上）
- 一千三百一十八 徐光启下乡（下）
- 一千三百一十九 赢了帝国首辅，输了回家入土
- 一千三百二十 最初的试验
- 一千三百二十一 养鸭治蝗
- 一千三百二十二 血吸虫之患（上）
- 请个假
- 一千三百二十三 血吸虫之患（下)
- 一千三百二十四 无药可治的病
- 一千三百二十五 群体灭螺
- 一千三百二十六 皇帝的意志
- 一千三百二十七 整顿惠民药局
- 一千三百二十八 百年大计
- 一千三百二十九 大秦的百姓还远远没有过上好日子
- 一千三百三十 召方从哲入京觐见
- 一千三百三十一 明哲保身的『哲』
- 一千三百三十二 方从哲的对策
- 一千三百三十三 方从哲抵达南京
- 一千三百三十四 培养医者的学校
- 一千三百三十五 医部
- 一千三百三十六 乡村游医计划
- 一千三百三十七 西南土改
- 一千三百三十八 北虏复来
- 一千三百三十九 秦军近代化（上）
- 一千三百四十 秦军近代化（下）
- 一千三百四十一 有面子的热那亚总督（上）
- 一千三百四十二 有面子的热那亚总督（下）
- 一千三百四十三 中国式的生活
- 一千三百四十四 倒霉的西班牙人
- 一千三百四十五 每天数钱数到手抽筋
- 一千三百四十六 梦想中的那个国度
- 一千三百四十七 大秦已经做好准备了
- 一千三百四十八 重拳出击
- 一千三百四十九 北伐的准备（上）
- 一千三百五十 北伐的准备（下）
- 一千三百五十一 隆武六年
- 一千三百五十二 新的宿命和方向
- 一千三百五十三 皇庄系统
- 一千三百五十四 羊毛纺织机
- 一千三百五十五 万事俱备
- 一千三百五十六 西北兵团首次出战
- 一千三百五十七 一路逃，一路死，一路血
- 一千三百五十八 藏兵来援
- 一千三百五十九 民生百业皆平等，无有高低贵贱之分
- 一千三百六十 一战功成
- 一千三百六十一 萧如薰的托付
- 一千三百六十二 终有一天，你要自己面对这些豺狼虎豹
- 一千三百六十三 等我回来
- 一千三百六十四 皇帝拔出了天子剑，剑指北海
- 一千三百六十五 隆武二十年（上）
- 一千三百六十六 隆武二十年（下）
- 一千三百六十七 秦皇立马碑
- 一千三百六十八 修路是百年大计
- 一千三百六十九 一寸山河一寸血
- 一千三百七十 吃外人还是比吃自己人要好
- 一千三百七十一 儿孙满堂
- 一千三百七十二 亲上加亲
- 一千三百七十三 愿我大秦繁荣昌盛，永世不衰
- 一千三百七十四 我来了
- 一千三百七十五 对不起（八千大章）
- 一千三百七十六 群臣始终没有看穿过皇帝哪怕一次
- 一千三百七十七 你来做这个皇帝吧
- 一千三百七十八 从此以后，你便是大秦的皇帝
- 一千三百七十九——一千三百八十 放我走吧
- 大结局 复国
- 完结感言