在登山过程中，袁崇焕问了问这随毛文龙而上的将官名称，发现这些大多都姓毛，有些好奇地问道：
“毛帅，这些将官和你真有缘呢，都同一个姓，说不定你们五百年前还是一家呢！”
毛文龙听后对袁崇焕解释道：
“袁帅您说笑了，他们本来不姓毛，我为了增强他们的战斗力，所以才给他们赐姓毛。
他们有的是我的义子，有的是我的义孙，在战场上都骁勇善战，以一当十。”
见这毛文龙竟然学着那太祖时期的蓝玉一样广收义子，袁崇焕在心中更加坚定了杀他的决心，不过表面上还是一副很赞同的样子，打趣他道：
“如今朝廷财政困难，军饷常常不足。你们在海外劳苦多日，每月禄米也只有那么一斛，即使如此你们还能成功屡次袭扰金兵，看样子都是毛帅您治军有方。
在条件困难的情况下，也只有自己人才靠的住，看样子回辽之后袁某也要收些义子了。”
两人谈笑风生了一番，渐渐地已经快走到山顶了。在快要到山顶的时候，袁崇焕命随行人员等候在山腰处守候，毛文龙此时已经完全放下了戒心，也就命那些将官随着赵率教等人一起在山腰处等候。
待袁崇焕与毛文龙两人单独上了山顶后，过了一会儿，只见袁崇焕长叹一声：
“哎，我也不愿如此，来人！”
一下秒只见附近草丛中出现近百名大汉，正是那谢尚政带着的八十名明军。
那毛文龙没有丝毫的防备，一下子就被擒住了，被捆成一个大粽子后他才反应过来，赶忙大声喊道：
“袁帅你到底要干什么，我好心好意招待你，你为何要如此对我！”
只见那已经下定决心的袁崇焕脸色一变，沉着脸说道：
“大胆毛文龙，你干了这些恶事还不自知，如今我要杀了你以正军纪！”
那毛文龙大喊无辜，袁崇焕让人扒下他的帽子和袍带，向那姜子牙读纣王罪状一样，将毛文龙的罪状一一道来：
“我就让你死也死个明白，你有十二条该斩头的大罪：
按照我朝太祖定下来的制度，凡是大将领兵在外，必须要接受文官的监视。而你在这边却施行一人专制，军马钱粮都不接受核查，这是一该杀；
作为臣子，什么罪都没有欺君之罪更大。而你不但欺君，还一直欺君。这些年来你送上朝廷的奏章全都是蒙骗圣上的，杀害投降的士兵和难民，假冒战功，这是二该杀；
作为大臣，不仅不能结党，更不能将朝廷的军队变为自己的私兵，有则必杀。而你竟然上书说在登州驻兵，取南京易如反掌，如此大逆不道，这是三该杀；
每年朝廷发放给你几十万两饷银，而你却一两都不发给士兵，并且每月只发放三斗半米，侵占军粮，这是四该杀；
茶马交易是朝廷一向禁止的，而你却擅自在皮岛开设马市，私自和外国人来往，这是五该杀；
你的部将有几千人都冒称是你的同姓，副将以下都随意发给布帛上千匹，而走卒、轿夫更是违规逾制地穿着品官官服和袍带，这是六该杀；
你身为我军大将，在从宁远返回途中，竟然劫掠商船，自己做了盗贼，给我军抹黑，这是七该杀；
身为军人，你不但没有做到保境安民的责任，反而残害当地百姓，强娶民间女子。如此不知法纪的行为，使得部下效仿，让百姓不安于家，这是八该杀；
为了获取那丰厚的报酬，你竟然驱使难民远去山林中帮你盗窃人参，而不听从的人就会被活生生地饿死。光这岛上的白骨已经数不胜数，其他地方可想而知，这是九该杀；
那魏阉乱政已久，为祸朝纲，如今幸得我皇施展手段一举剪除。而你作为镇守一方的大将，之前不但没有做到与阉党划清界限，反而用车送金子到京师，拜那魏老狗为父，并在岛上雕塑他加冕冠的肖像，一副奴颜婢膝的样子丢尽了我大明官兵的脸，这是十该杀；
之前你在铁山一战败北，丧师不计其数。而你不但没有将功折罪，反而掩败为功，欺骗朝廷，这是十一该杀；
自从东江镇设立以来已有八载之久，你身为该镇的主将，在这期间却不能收复一寸土地。
正是由于你的坐地观望政策，让那后金日渐壮大，害得我辽东连年战乱，如此这般姑息养敌，这是十二该杀。
这十二条大罪条条罄竹难书，本帅可有冤枉你的！”
在袁崇焕宣布完毛文龙的罪状后，只见那毛文龙冷汗连连，不敢再做丝毫的辩驳，丧魂失魄，说不出话来，只是叩头请求袁崇焕能够免除他一死。
袁崇焕也不多说，如今这大明朝哪个官员没有罪，那些边军大将犯下的罪行更是数不胜数，但为了局势稳定，大家都相安无事，若是这毛文龙识相交出军饷的话，自己又何以至此呢？
不过如今既然已经撕破脸了，就不能再心慈手软，袁崇焕当下命人将毛文龙押到大帐之前。
沿途遇到那些毛文龙的孝子贤孙，虽然对此有所疑惑，但看着袁崇焕手持的尚方宝剑却没人敢动，只能随着他一同下山而去。
在召集了双岛全体官兵后，他对着众人宣读毛文龙的罪状，期间有的将领用这些年来毛文龙的辛劳来替他求情，却被袁崇焕严词拒绝，只见他大声训斥道：
“毛文龙本是一个平民百姓罢了，官做得最高，全家都得以荫封，足够报他的辛劳了，他怎么就这样悖乱违逆呢！”
接着他就朝着北京城方向磕头，请求皇帝的旨意说：
“我今天杀毛文龙以整顿军纪。若是将领中间有和毛文龙一样的，都要杀了他们。我不能成功的话，请皇上也像杀毛文龙一样杀了我。”
话音刚毕，袁崇焕就亲自取出尚方宝剑在帐前把毛文龙的头砍了下来。
砍完之后，他对着双岛的将士大声说道：
“罪在毛文龙一人，大家都受了他蒙蔽，我只杀他一人，大家还是像以前那样报效朝廷就是了。”