第三天下午，朱由校再次在玉熙宫召见了李树宗与万机两人。
“辛苦两位神医了，帮朕看清了御药房与太医院的医术现状！”
“能为陛下分忧，是草民的荣幸！”
“大伴，两位神医考核合格的医师，都调查完了吧？”
“回皇爷，已经完成了，御药房与太医院的四位考核合格御医，多多少少都有点不太干净的关系！”
“那就将御药房的两位御医调到太医院，再将太医院那些通过考核并没有问题的医师，全部调入御药房！”
“是，皇爷！”
“另外，将御药房改成内医堂，万神医与李神医两人分别为正四品与正五品的正副大使！”
“是，皇爷，不知是否要设立院判与御医？”
“院判就不必了，你安排一名内侍过去当协理，配合两位神医对内医堂的管理！”
“是，皇爷，奴婢一定会选一位十分妥帖的人过去！”
“好，再设立正六品的御医六名，正八品的医师十名，其它的学徒与吏员帮工人数，由两位神医协商确定！”
“是，皇爷！”
魏忠贤的话音刚落，万机与李树宗两人赶忙激动地跪在地上谢恩道：“臣等谢陛下隆恩！”
太医院的院正也才正五品，而他们两人一下子成了正四品与正五品的正副大使，怎能不激动。
虽然御药房的御医不好当，但里面的名贵药材也的确是十分丰富，足够他们研究许久。
“既然朕将内医堂交给了两位神医，希望你们能够帮朕好好把好关，都平身吧！”
“谢陛下！”
“大伴，帮两位神医在东安门外各找一处四进的院子！”
“是，皇爷！”
京城的房子本就一房难求，现在皇帝却赏赐了皇城根四进的大宅子，两人再次连忙跪地谢恩道：“臣等谢陛下赏赐！”
“这是你们应得的，你们可以将你们的家人接来京城居住了，以后有什么需要的药材，尽管找大伴安排的协理去办！”
“是，陛下！”
“另外，为了以后的内医堂不至于再像原先的御药房，内医堂内必须每年进行一次考核，考核达标者才能保持原先的品级，若不达标，直接降级，若降无可降，直接赶出内医堂。当然，有罚就有赏，那些考核优秀之人，也要相应提升他们的品级与额外的奖赏！”
“是，陛下，臣等遵旨！”
“嗯，除了考核，朕还想让内医堂的御医们各带三到五名内廷有学医天赋的小宦官，今后主要负责对中下级宦官与宫女的身体医治！”
这些中低级宦官宫女，一辈子几乎都很难有机会出宫，但人吃五谷，身体总会有各种各样的问题，需要医师的及时救治。
过去御医基本很少去给这些人治病，他们要么花重金请御药房的医师治病，要么靠他们自己的身体死熬。
熬过了，算他们命硬，若熬不过去，只能算他们倒霉。
从底层小宦官慢慢爬起来的魏忠贤，自然十分了解其中的秘辛。
所以，当他回答朱由校的话时，身体还不自觉地出现了颤动，“是，皇爷，奴婢谢皇爷体谅我们这些卑贱的无根之人！”
看着即将掉泪的魏忠贤，朱由校安慰道：“好了，朕也只不过是做了一件微不足道的小事情，你平时多帮朕盯一盯内医堂，就是最大的感谢了！”
魏忠贤抹了抹眼泪后，躬身答道：“是，皇爷，奴婢一直会替皇爷好好盯着内书堂的！”
“这就对了嘛！”
接下来几天，在魏忠贤派去的协理帮助下，万机与李树宗两人快速完成了对御药房的人员整顿。
根据医术水平高低进行品级重新调整的内医堂，气氛为之一变，不再是过去那种排资论辈、讲出生与阿谀奉承的肮脏之气。
有了考核与奖惩机制后，内医堂内不管是御医还是普通医师，都争相开始了专研医术。
甚至连最低级的吏员与帮工，在看到翻身的希望后，也在刻苦翻读医书，御医在看病的时候，也会很认真地在一旁观摩学习。
朱由校与内医堂的新御医们是高兴了，但那些被赶到太医院，甚至是直接被裁撤之人，自然就十分不高兴了。
他们联合外朝的好事官员，纷纷弹劾万机与李树宗两人，说他们乡村野医根本不配给宫内贵人看病等等。
甚至还有科道言官规劝朱由校这个皇帝不该随意更改祖制，调整御药房的架构与考核机制等等。
面对这种恶心的苍蝇，朱由校一律发配琼州岛支教。
本来想着继续发配西南的，但马上想到这些人很可能会联合土司，一起来对付朝廷官军，便改成了天涯海角，让他们天天去吃海鲜大餐去。
两宋不就喜欢将那些嘴炮流放琼州岛嘛，他朱由校自然也可以有样学样。
将这些人流放过去，说不定还能继续改善琼州岛的文化与饮食建设，也算是他们对大明所剩不多的贡献。
在内医堂整顿完没多久，朱由校又开始了对内书堂的整改。
以前的内书堂讲师，都是由翰林院的翰林充任。
而这，就给了文官们勾连内廷的天然机会。
而大明的翰林，又多出自东南几个布政司。
东林党这种以党争与争权夺利为目的组织出现前，或许还没那么糟糕，但自从他们出现了，内书堂的讲师教导宦官读书时，就夹带了大量的私货。
最明显的例子，就是不久前刚被朱由校拿下的王安、魏朝与王体乾三人。
他们三人都是出身内书堂，一直充任东林党在内廷的探子兼联络人，同时兼顾影响储君与皇帝的思想走向。
所以，朱由校喊来了司礼监掌印与几个秉笔，让他们停止了现在在内书堂教书的翰林。
同时，以后也彻底结束翰林给宦官当老师的历史，改由德高望重的老宦官充任。
虽然这有可能加快内廷的党争，但总要好过内外勾结来共同对付皇帝强。
切断了翰林这层联系之后，内廷算是与外朝形成了两个完全独立的组织，更有利于权力的互相监督，以及方便皇帝对政务的分权。
不过，因有了上次弹劾内医堂被贬琼州岛之事，此次的内书堂调整，表面上并没有掀起太大的波澜。